Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SRCAPQ6ZRS2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRCAPQ6ZRS2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms