Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCNI2Q6ZMN8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCNI2Q6ZMN8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms