Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A10Q6U841 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A10Q6U841 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms