Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC137Q6PK04 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms