Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCLRE1AQ6PJP8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLRE1AQ6PJP8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms