Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CSAG1Q6PB30 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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