Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 AZIN1-203ENST00000517581 576 ntTSL 48.12□□□□□ -1.114e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 AZIN1-206ENST00000518940 574 ntTSL 37.81□□□□□ -1.164e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 AZIN1-204ENST00000518353 773 ntTSL 56.24□□□□□ -1.414e-9■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.135e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.235e-8■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.45e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.525e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.85e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.95e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 519.81■□□□□ 0.761e-20■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 BMI1-209ENST00000602523 748 ntTSL 1 (best)18.58■□□□□ 0.578e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 SS18-218ENST00000581021 588 ntTSL 417.04■□□□□ 0.328e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.118e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.038e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 PSPH-207ENST00000421626 826 ntTSL 415.16■□□□□ 0.028e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.638e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DEGS1-203ENST00000415210 957 ntTSL 511.02□□□□□ -0.658e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 TMEM39B-209ENST00000498613 854 ntTSL 310.53□□□□□ -0.728e-11■■■■■ 40.5
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PRPF8Q6P2Q9 ZBTB49-206ENST00000515012 2380 ntTSL 1 (best)10.33□□□□□ -0.768e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZBTB49-202ENST00000502918 502 ntTSL 310.12□□□□□ -0.798e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.82e-8■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPBAP1-201ENST00000306103 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.818e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ST13-203ENST00000413424 630 ntTSL 39.98□□□□□ -0.811e-10■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.828e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF619-209ENST00000521353 1869 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.838e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GTF2H1-207ENST00000526461 568 ntTSL 29.73□□□□□ -0.858e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GLYR1-204ENST00000586901 582 ntTSL 39.5□□□□□ -0.898e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATG5-208ENST00000635758 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.898e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CDC37L1-201ENST00000381854 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.928e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATG5-203ENST00000369070 3088 ntTSL 1 (best)9.29□□□□□ -0.928e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 CNOT10-207ENST00000455381 770 ntTSL 59.17□□□□□ -0.948e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 PSPH-211ENST00000459834 692 ntTSL 39.14□□□□□ -0.958e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.978e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF619-202ENST00000429348 4104 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.998e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ISCA2-202ENST00000554924 489 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -18e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF619-204ENST00000447116 4153 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.028e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 NPIPB5-203ENST00000415654 5708 ntTSL 58.52□□□□□ -1.058e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPBAP1-203ENST00000465044 2986 ntTSL 28.27□□□□□ -1.098e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 GEMIN6-202ENST00000409011 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.18e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 ZNF619-203ENST00000432264 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.128e-11■■■■■ 40.5
PRPF8Q6P2Q9 TTLL5-204ENST00000554148 705 ntTSL 58□□□□□ -1.135e-8■■■■■ 40.5
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