Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDC4Q6P2E9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDC4Q6P2E9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms