Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC42EP5Q6NZY7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms