Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KANK3Q6NY19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KANK3Q6NY19 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KANK3Q6NY19 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KANK3Q6NY19 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms