Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NEPROQ6NW34 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NEPROQ6NW34 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms