Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCSD1Q6JBY9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms