Protein–RNA interactions for Protein: Q6AWC8

Putative uncharacterized protein LOC100129027, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6AWC8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6AWC8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6AWC8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6AWC8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms