Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TXNDC8Q6A555 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TXNDC8Q6A555 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms