Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E4F1Q66K89 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E4F1Q66K89 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms