Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CARMIL1Q5VZK9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CARMIL1Q5VZK9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms