Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF18Q5VWM3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF18Q5VWM3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms