Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC30Q5VVM6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC30Q5VVM6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC30Q5VVM6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC30Q5VVM6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC30Q5VVM6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC30Q5VVM6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC30Q5VVM6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms