Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC38Q5VT99 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC38Q5VT99 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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