Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C12orf60Q5U649 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf60Q5U649 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms