Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HIVEP3Q5T1R4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HIVEP3Q5T1R4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms