Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAPCD1Q5SSQ6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAPCD1Q5SSQ6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms