Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC158Q5M9N0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC158Q5M9N0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms