Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC27A3Q5K4L6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms