Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LONRF3Q496Y0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LONRF3Q496Y0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms