Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SP6Q3SY56 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SP6Q3SY56 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms