Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LSM12Q3MHD2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LSM12Q3MHD2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms