Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCGF3Q3KNV8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms