Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P3H1Q32P28 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
P3H1Q32P28 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P3H1Q32P28 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P3H1Q32P28 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P3H1Q32P28 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P3H1Q32P28 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P3H1Q32P28 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms