Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KLHL40Q2TBA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL40Q2TBA0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms