Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B3Q16720 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B3Q16720 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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