Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXD1Q16676 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FOXD1Q16676 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
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