Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SGCBQ16585 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SGCBQ16585 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
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SGCBQ16585 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SGCBQ16585 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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