Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRNP35Q16560 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRNP35Q16560 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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