Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PMCHL1Q16048 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PMCHL1Q16048 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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