Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CDSNQ15517 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CDSNQ15517 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDSNQ15517 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CDSNQ15517 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CDSNQ15517 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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CDSNQ15517 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDSNQ15517 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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