Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SKIV2LQ15477 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms