Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNN3Q15417 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CNN3Q15417 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms