Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SF3B3Q15393 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SF3B3Q15393 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
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