Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAM2Q15035 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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