Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EXOSC7Q15024 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EXOSC7Q15024 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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