Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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NR1D2Q14995 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NR1D2Q14995 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NR1D2Q14995 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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