Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR1I3Q14994 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NR1I3Q14994 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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