Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPNMBQ14956 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPNMBQ14956 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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