Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
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GBX1Q14549 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBX1Q14549 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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