Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RUNX2Q13950 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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