Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNTB1Q13884 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNTB1Q13884 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms