Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PKP1Q13835 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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