Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SPTAN1Q13813 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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