Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOFQ13790 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
APOFQ13790 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
APOFQ13790 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOFQ13790 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOFQ13790 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
APOFQ13790 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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